«

»

Сен 25

1. Почему эндогенные ретровирусы (ЭРВ), являющиеся остатками древних вирусов, расположены в одних и тех же местах генома человека и шимпанзе?

Почему эндогенные ретровирусы (ЭРВ), являющиеся остатками древних вирусов, расположены в одних и тех же местах генома человека и шимпанзе?

Очень часто на страницах интернета, в научно-популярных книгах и передачах говорится о схожем расположении эндогенных ретровирусов у человека и шимпанзе, как ярчайшем свидетельстве эволюции, и, в частности, происхождении человека и современных обезьян от общего предка, который и был заражён этим вирусом.  

Так, в одной из публикаций на данную тему мы читаем: «… эти ретровирусы – следы прошлых встреч живых организмов с вирусами типа ВИЧ и другими. Миллионы лет назад они атаковали клетки живших тогда организмов. И если организм не погибал, а успешно справлялся с вирусной атакой, то вирусы в «разобранном» (деактивированном) состоянии оставались в клетках, уже потеряв свою способность к инфицированию. Если вирусом заражались клетки половой линии, то эндогенный ретровирус передавался из поколения в поколение, путешествуя таким образом по геномам иногда миллионы лет. После расшифровки нуклеотидной последовательности ДНК многих животных, в том числе и человека, стало возможным узнать, где именно в геноме находятся эти остатки древних вирусов. И взору ученых предстала строгая упорядоченность расположения эндогенных ретровирусов – выяснилось, что все они находятся в геномах в строго определенных местах. Некоторые из них характерны лишь для человека или для кошки и не встречаются у других животных. Другие же ретровирусы можно обнаружить в одном и том же месте, к примеру, в геномах гориллы, шимпанзе, орангутанга и человека. Вероятность того, что вирусы атаковали клетки и случайным образом встроились в геномы разных видов на абсолютно одинаковые позиции среди миллиардов других нуклеотидов, чрезвычайно мала. Это все равно, как если бы несколько миллионов человек взяли в руки «Войну и мир» и, не сговариваясь, указали бы на одно и то же слово на одной и той же странице. Все это говорит в пользу того, что в процессе эволюции обломки вирусов в клетках передавались из поколения в поколение и от одних видов другим. И то, что ретровирусы находятся у двух или более животных на одной и той же позиции в ДНК, недвусмысленно говорит о том, что эти животные произошли от общего предка».

Однако, хотелось бы обратить внимание, что этот аргумент является ненаучным, т.к. в нём нарушены все правила научной аргументации: те положения, которые сами нуждаются в доказательстве, уже выступают в качестве доказательств других положений.  Давайте разберёмся…

Как известно, почти половина генома человека и многих животных состоит из разного рода повторяющихся последовательностей ДНК. Часть из них кодирует фермент ревертазу (обратную транскриптазу), которая в цитоплазме клетки синтезирует ДНК на матрице РНК. Эта вновь синтезированная ДНК способна снова возвращаться в ядро и встраиваться в гены клетки. Такие ДНК (как исходные, так и вновь встроенные) называются ретротранспозонами, а описанный процесс обеспечивает их «размножение» в геноме. Точно таким же образом функционируют и ретровирусы (к ним относится и широкоизвестный вирус иммунодефицита человека).

Но у животных (и у человека) существует, и другая часть повторяющихся последовательностей, которые не содержат фрагмента, кодирующего ревертазу, а потому не способна размножаться независимо от остальной части ДНК и даже перемещаться по геному, а потому может только передаваться из поколения в поколение при делении клеток. Что это за фрагменты и для чего они нужны?

Было выдвинуто предположение, что данные последовательности представляют собой ретровирусы, утратившие способность осуществить полный цикл своего развития. Их условно называют эндогенными ретровирусам (ЭРВ). (Хотелось бы отметить, что термин не очень удачный, так как указывает на возможное происхождение данных последовательностей, что обычно в терминологии не допускается). ЭРВ относится к так называемой «мусорной части ДНК», которая не несёт никакой функции и является ненужным балластом.

Далее было замечено, что у человека и шимпанзе некоторые так называемые ЭРВ расположены в аналогичных местах геномов и предполагается, что это следы ретровирусов, встроившихся в геном их общего предка. Для другой части ЭРВ расположение в геноме отличается у шимпанзе и человека и считается, что они попали туда уже после отделения ветви человека от остальных приматов.

Расположение ЭРВ в одних и тех же местах ДНК человека и обезьян, свидетельствует о происхождении человека от общего с шимпанзе и другими обезьянами предка, т.к. вероятность того, что ретровирус (впоследствии ставший ЭРВ) встроится в одну и ту же часть генома и у человека, и у шимпанзе равна нулю.

Казалось бы всё прекрасно, однако утверждение, что данные последовательности ДНК являются остатками ретровирусов является не более чем гипотезой. Не существует никаких доказательств, что это остатки именно древних ретровирусов, а не остатки, например, ретротранспозонов самих клеток эукариот.

Но даже если это и остатки ретровирусов, то нужно доказать, что древние ретровирусы могли встраиваться в любое место ДНК клеток (что также является не более чем гипотезой). Ведь известно, что современные ретровирусы животных встраиваются только в один определенный участок генома во всех зараженных клетках, хотя известно четыре ретровируса, патогенных для человека (Т-лимфотропный вирус человека типа 1, Т-лимфотропный вирус человека типа 2, ВИЧ-1 и ВИЧ-2), которые встраиваются в клеточную ДНК случайным образом.

Кроме этого, непонятно что от чего произошло: данные последовательности ДНК от ретровирусов или наоборот, ретровирусная ДНК от этих последовательностей.

Только после подтверждения всех этих гипотетических представлений можно вести разговор о доказательствах происхождения человека и современных обезьян от общего предка.

Однако в последнее время генетики сделали открытия вообще лишающие данный аргумент какого-либо смысла. Выяснилось, что многие последовательности ДНК, которые мы именуем «эндогенными ретровирусами», является вполне функциональной, однако функционируют они только в определённых типах тканей. Именно поэтому их функция долгое время была неизвестна, отчего эту ДНК рассматривали как «мусор». Эти последовательности ДНК действуют как промоторы: они стартуют транскрипцию в различных отправных точках и благодаря этому из одной и той же последовательности ДНК образуются разные РНК-транскрипты [Faulkner G., Kimura Y., et. The regulated retrotransposon transcriptome of mammalian cells // Nature Genetics. 2009. № 41, Р. 563–571 https://www.nature.com/articles/ng.368].

Учёные одного из крупнейших образовательных и научно-исследовательских центров США – Технологического института Джорджии, – ещё в 2008 г. обнаружили 51197 промотерных последовательностей, полученных из эндогенных ретровирусов, которые инициируют внутри человеческого генома транскрипцию. Сюда относятся и 1743 случаев, когда транскрипция начинается с последовательностей эндогенных ретровирусов, расположенных в проксимальном промоторе гена. Анализ выявил, что ретровирусные последовательности в человеческом геноме кодируют десятки тысяч активных промоторов. [Conley A., Piriyapongsa J., Jordan I. Retroviral promoters in the human genome // Bioinformatics, Vol. 24, Issue 14. 2008. P. 1563–1567 https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btn243]

Таким образом, то, что считалось нефункциональным остатком древних ретровирусов, оказалось тканеспецифичным клеточным промотором, т.е. элементом сверхсложной кодировки, обеспечивающей целостную и скоординированную работу организма.

Конечно, можно оправдать апологетов учения Ч. Дарвина тем, что этот аргумент начали использовать тогда, когда ещё ничего не было известно о промоторной активности ЭРВ (а сегодня продолжают как бы по инерции). Однако, чтобы мы ни говорили, но использование гипотетических представлений о функционировании генома в качестве доказательств чего бы то ни было  неправомерно, и свидетельствует скорее о низком профессионализме учёного, об игнорировании им основных критериев научного знания и о слабом понимании сущности самой науки.

 

2 комментария

  1. олег

    В геноме шимпанзе и человека встречаются одинаковые «повреждения» с последующими утверждениями атеистов в их правоте.

    Но как я понял из этой статьи, дефектами от внедрения вирусов эти фрагменты считались ошибочно. На самом дели они не язвы, а полезные детали.

    Тем не менее и в этом случае возникает вопрос, почему шимпанзе и человек обладают такими общими особенностями.

  2. Алексей

    Смешно, конечно. Так же нет доказательств, что ИМЕННО ТЕ последовательности не ретеровирусные остатки. И далее — даже если это не ретеровирусные остатки, то само наличие совершенно идентичного участка в геномах разных семейств, разделившихся довольно давно всё равно говорит, что у них ещё до уровня разделения был предок с такими же участками ДНК))). В чём проблема то?

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *